馬薩里克大學以其高度的知識能量與抱負，很快在許多領域贏得了很高的榮譽。馬薩里克大學法學院是該大學的驕傲。“布爾諾的法學院”以標準化法律理論為基礎，取得了國際榮譽。馬薩里克大學的其它學院也同樣充滿活力，取得了很大的成功。

1964年教育學院合并入馬薩里克大學，1989年11月之后再度繁盛。1990年，經濟與行政管理學院成立，隨后于1994年建立信息學院，1998年社會研究學院社，并于2001年建立體育研究學院。作為國際合格，大學的研究活動也大大增加，不僅有雙邊合作(與單個國外大學)還包括Compostela Group of Universities大學集團內的合作。

今天，馬薩里克大學是捷克共和國公認的最重要的教育和研究機構，是一所遵循民主傳統的、值得尊敬的中歐大學。馬薩里克大學也是布爾諾及周邊地區主要的社會和文化支柱。

馬薩里克大學院系設置：

馬薩里克大學設有9個學院，共有200多個系、專科學院及講習所，涵蓋了廣泛的學科和研究領域。

馬薩里克大學專業設置：

法學院 – 法律專業、法律與法律科學、理論法律科學。

醫學院 – 護理、健康科學、普通內科、口腔病學、牙科專業。

理科學院- 數學、應用數學、地質學、地理學、地理與繪圖學、應用地理、生物化學、化學、應用生物化學、生物學、人類學、人類生物學、物理、應用物理、中學師資培訓。

文科學院- 哲學、人文科學、歷史科學、信息與圖書館學、語言學、教育學、專業教育學、一般理論及文科與文化史論、中學師資培訓、小學師資培訓。

教育學院 – 教育學、小學師資培訓、特殊教育學、專業化教育學、中學師資培訓、教學助理培訓、健康科學、美術理論與歷史、音樂理論與歷史。

經濟學院-經濟學理論、經濟政策與行政管理、經濟與管理、系統工程和信息學、經濟學定量分析法。

信息學院– 信息學、應用信息學、中學師資培訓。

社會研究學院-人文科學、政治學、國際區域研究、社會學、社會政策與社會工作、政治學、人文環境、媒體與傳播學。

體育研究學院 – 體育與運動、親屬人類學。

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